Bộ phim đi theo 2 nhân vật chính, 2 câu chuyện khác nhau, người mà phát hiện ra bản thân mình kẹt trong những sự việc bí ẩn bao gồm hai thứ được gọi là "material fairies" (bản dịch tiếng Việt là những nàng tiên hiện hữu hay cách gọi khác là "tiên hữu hình") và "material evils" (bản dịch tiếng Việt là quỷ hiện hữu hay cách gọi khác là "quỷ hữu hình"). Khi họ đang phải đối mặt với những thực thể huyền bí này, cuộc sống bình thường của họ vẫn tiếp diễn với những lúc thăng trầm cùng với bạn bè mình.

Nội dung chính xoay quanh hai nhân vật chính trong xuyên suốt câu chuyện, đầu tiên là Ayumu Aizawa, người đang đến thăm ngôi làng nhỏ của cha mình ở vùng Tana nhân dịp nghỉ hè; thứ hai là Kisa Tanigawa ở Yokohama, gần hai năm sau quãng thời gian của phần đầu câu chuyện.

Summer

12 tập đầu tiên của bộ phim xoay quanh cuộc sống của Ayumu Aizawa trong những ngày cậu thăm cha mình, một bác sĩ thú y, tại một thị trấn nhỏ ở miền quê. Ayumu dự định chỉ tham quan hết thung lũng này bằng xe đạp của mình, nhưng lại thay đổi lại khi gặp một cô bé có tên là Miku và nhận một lời nhắn đi tìm người bạn mất tích thời thơ ấu là Wakkun từ cô bé. Khi gặp được Wakkun, câu nhận ra rằng cậu bé đó đã không hề lớn lên kể từ khi chơi cùng mình thời thơ ấu. Wakkun cũng mặc một bộ trang phục giống với chiếc áo mưa màu vàng và đôi bốt cao mà hồi bé Ayumu thường mặc. Wakkun giới thiệu Ayumu với Dosshiru (Doss) và Shisshin (Sense), hai vật thể bay bí ẩn thường biển đổi giữa hai hình dạng quả cầu vàng phát sáng và hình dạng vật chất.

Những quả cầu phát sáng đó dường như vô hình đối với mọi người trong làng nhưng lại hiện hình rất rõ trong mắt người và động vật. Một phóng viên địa phương, Akira Sukawara, xuất hiện, bị thu hút bởi câu chuyện về kappa và những sự kiện kì bí xảy ra gần đấy. Cô đi theo các con vật, đặc biệt là con mèo mà một cậu thanh niên trong vùng nói là đã thấy nó đánh nhau với kappa, và những ánh sáng màu vàng, và chất vấn một cách miễn cưỡng Ayumu để có thêm thông tin. Không thể nhớ lại được ký ức thời bé khi mình đến ngôi làng này, Ayumu, với sự giúp đỡ của Miku và những người khác trong ngôi làng Tana, cố gắng tìm hiểu xem chuyện gì đã xảy ra khi cậu còn là một đứa bé, và mối liên hệ bí ẩn gữa cậu, Wakkun, Dosshiru, và Shisshin...

Winter

Một năm rưỡi sau, Kisa Tanigawa, một học sinh trung học luôn buồn chán, thường xuyên bỏ học. Một buổi tối, đang lang thang trong thành phố, cô vấp phải một vật thể bí ẩn khác. Đặt tên là "Bun-chan" hay "Ping" trong bản tiếng Anh, theo âm thanh mà thứ đó phát ra, cô đem nó về nhà và nuôi như một con thú cưng. Khi cô có gắng lấy con cá ra khỏi một mảnh kim loại, chiếc vây trên cùng không đứng yên, nên Bun-chan (Ping) giúp cô dán nó lại. Cùng lúc ấy, Sukawara lại xuất hiện và cố chứng minh sự tồn tại của cá vật thể bí ẩn tại vũ hội mèo ở Tana một năm rưỡi trước, thứ được cô đặt là "những nàng tiên hiện hữu", và nghe tin về Bun-chan. Từ bằng chứng trong cuộc gặp gữa Ayumu và Kisa, cô không gọi Bun-chan là "những nàng tiên hiện hữu", mà là "quỷ hữu hình", dựa vào sự khác biệt bề ngoài giữa chúng. Những nàng tiên hiện hữu và quỷ hữu hình dường như đang có một cuộc chiến với nhau. Khi cả ba gặp nhau, Dosshiru, Shisshin và Bun-chan. Dosshiru và Shisshin bắt đầu truy đuổi Bun-chan và phá hủy nó nhanh chóng, để lại Kisa trong đau khổ khi nhìn thấy Bun-chan đã chết. Sau một thời gian, mối liên kết giữa những chiếc vảy của con cá của Kisa bắt đầu phát ra ánh sáng sặc sỡ. Một đêm, con cá đó biến thành hình dạng tiên của Bun-chan. Kisa sau đó đặt tên nó là Po-chan.

Người dân trong thành phố ngày càng lo sợ, khi mà bức tranh của vật chất ma quỷ, quả cầu tròn phát ra ánh sáng xanh, xuất hiện trên nhiều chiếc điện thoại di động, đi kèm với lời đồn rằng chúng đem lại may mắn. Một bức tranh tường đường phố xuất hiện và cảnh báo mọi người hãy suy nghĩ và tin tưởng chính mình. Cùng lúc đó, một vật thể có hình xoắn ốc khổng lồ xuất hiện trên bầu trời, giống với một kiến trúc bằng kim loại của quỷ hữu hình, và cảnh sát đã di tản toàn bộ dân cư trong khu vực. Một vài hiện tượng lạ cũng xảy ra giống như ở làng Tana, như việc các thiết bị điện tử không hoạt động.